средство для инактивации вирусов, обладающее одновременной рибонуклеазной, мембранолитической и противовирусной активностями
Классы МПК: | A61P31/12 противовирусные средства A61K38/00 Лекарственные препараты, содержащие пептиды C07C229/02 амино- и карбоксильные группы, связанные с ациклическими атомами углерода одного и того же углеродного скелета |
Автор(ы): | Королева Людмила Сергеевна (RU), Власов Валентин Викторович (RU), Гончарова Елена Павловна (RU), Зенкова Марина Аркадьевна (RU), Ковалев Николай Алексеевич (RU), Ковпак Михаил Павлович (RU), Сильников Владимир Николаевич (RU), Тамкович Николай Вячеславович (RU) |
Патентообладатель(и): | Учреждение Российской академии наук Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН (ИХБФМ СО РАН) (RU) |
Приоритеты: |
подача заявки:
2008-12-17 публикация патента:
20.09.2010 |
Изобретение относится к области химии и медицины. Охарактеризовано средство для инактивации вирусов, представляющее собой производные лизина, глутаминовой и 6-аминогексановой кислот. Представленное средство обладает рибонуклеазной, мембранолитической и противовирусной активностями и может быть использовано в медицине как активные компоненты для разработки лекарственных форм препаратов, используемых для лечения вирусных заболеваний. 6 ил., 4 табл.
Формула изобретения
Средство для инактивации вирусов, обладающее одновременной рибонуклеазной, мембранолитической и противовирусной активностями, представляющее собой производные лизина, глутаминовой и 6-аминогексановой кислот, связанные линкером гидрофобной природы, со структурными формулами (соединения 1 и 2):
Описание изобретения к патенту
Изобретение относится к области химии и медицины, а именно к соединениям, обладающим одновременной рибонуклеазной, мембранолитической и противовирусной активностями.
Вирусные заболевания представляют собой общую угрозу здоровью населения во всем мире. Среди вирусов вирусы, содержащие геном в виде РНК, вызывают целый ряд серьезных заболеваний животных (домашних и диких) и являются одними из наиболее опасных для человека. Высокопатогенные РНК-вирусы, такие как вирус гриппа птиц (Avian Influenza Virus), клещевой энцефалит (Tick-borne enchefalitis), вирус Денге (Denge virus), коронавирус (SARS) и т.д., являются постоянной угрозой для здоровья населения. На сегодняшний день особую опасность представляют вирусы птиц и животных, способных заражать людей (Lipsitch, M. et al. Science, 2006, 312, 845; Krug, R.M. Science, 2006, 311, 1562-1563; Chen, H. et al. Nature, 2005, 436, 191-192). Например, долгое время считалось, что вирус гриппа птиц не может переходить к людям, однако в последние годы было зарегистрировано большое число передач вируса от птиц к человеку, что вызывало смертельные исходы у заразившихся людей (Subbarao, K. et al. Science, 1998, 279, 393-396; Fouchier, R.A. et al. Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 2004, 101, 1356-1361). Вспышки высокопатогенного вируса гиппа H5N1 в некоторых азиатских и европейских странах вызвало серьезное опасение со стороны мирового сообщества (Koopmans, M. et al. Lancet, 2004, 363, 587-593; Enserink, M., Science, 2006, 311, 932; Fabain, N.J. Environ. Health 2006, 68, 46-63).
Опасность эпидемий и пандемий, вызванных РНК-вирусами, делает разработку новых противовирусных препаратов и новых средств и способов их инактивации одной из наиболее актуальных задач сегодняшнего дня.
В настоящее время в качестве средств инактивации вирусов используют физические методы (облучение ультрафиолетовым светом, ионизирующее излучение, нагревание при повышенном давлении) и целый ряд химических соединений (формалин, -пропиолактон, этиленимин, ряд детергентов), которые различаются механизмом действия и, следовательно, областью применения, токсичностью, эффективностью инактивации вируса и стоимостью (De Benedictis, P. et al. Zoonoses Public Health. 2007, 54(2), 51-68).
Спектр соединений, позволяющих инактивировать вирус, в том числе и для получения цельновирионных вакцин, ограничен несколькими соединениями: это формальдегид, -пропиолактон (Goldstein M. and Tauraso N., Applied Microbiol., 1970, 19, 290-294), этиленимин и его производные (Budowsky E.I., et al, Vaccine, 1991, 9, 473-476; Aarthi d., et al, Biologicals, 2004, 32, 153-156), облучение УФ-светом (Budowsky E.I., et al, Arch. Virol., 1981, 68-239-246) или УФ-светом в присутствии соединений, повышающих фоточувствительность вируса (Kasermann F and Kempf С., Antiviral Res., 1997, 34, 65-70), окисление кислородом воздуха на свету (Kasermann F. and Kempf С., Rev. Med. Virol, 1998, 8, 143-151). Известно, что обработка вируса такими соединениями приводит к частичному разрушению вирусных антигенных детерминант и тем самым к снижению иммуногенных свойств вакцин, а выборочное разрушение формалином антигенных детерминант поверхностных гликопротеидов вирусов может индуцировать развитие несбалансированного иммунного ответа (Kasermann F., et al., Antiviral Res., 2001, 52, 33-41).
Идеальной мишенью для инактивации вируса гриппа и других РНК-содержащих вирусов (далее по тексту РНК-вирусы) является геномная РНК вируса. После ее разрушения вирус теряет способность к репликации и, таким образом, не может размножаться.
Наиболее близкими к заявляемым соединениям - прототипом являются производные лизина общей формулы nLm, обладающие рибонуклеазной активностью (Ждан Н.С. и др., Биоорган. химия. 1999, 25, 723-732). На фиг.1 представлена структурная формула соединений nLm, представляющих собой неприродные пептиды на основе лизина, где n - число остатков лизина, m - суммарный положительный заряд соединения при нейтральном рН. Было показано, что хотя эти соединения и проявляют высокую рибонуклеазную активность, эффективность расщепления ими РНК зависела от пространственной структуры этой РНК, не коррелировала с суммарным положительным зарядом молекулы (определяет эффективность связывания с РНК) и мало зависела от числа остатков лизина в молекуле.
Недостатками известных соединений nLm являются относительно невысокая рибонуклеазная активность и низкая эффективность инактивации РНК-вирусов.
Технической задачей изобретения является получение эффективных, низкотоксичных синтетических соединений (искусственных рибонуклеаз), обладающих одновременной рибонуклеазной, мембранолитической и противовирусной активностями.
Поставленная техническая задача решается предлагаемым средством для инактивации вирусов, обладающим одновременной рибонуклеазной, мембранолитической и противовирусной активностями, представляющим собой производные нескольких аминокислот (АК), связанных гидрофобным линкером (L) общей формулы
[nAK]2L, где n - число разных аминокислот в молекуле соединения, равное единице для соединения (1) или трем для соединения (2); L - додецильный линкер, АК - глутаминовая кислота для (1) и лизин, 6-аминогексановая и глутаминовая кислоты для (2). На фигуре 2 представлены структурные формулы соединений (1) и (2).
Для повышения рибонуклеазной активности соединений (1) и (2), по сравнению с прототипом, в их структуру была добавлена новая каталитически активная группа (карбоксигруппа), которая присутствует в активном центре многих природных рибонуклеаз. Присутствие в молекуле как отрицательно, так и положительно заряженных функциональных групп позволяет повысить эффективность реакции расщепления РНК. Кроме того, в молекулу был введен протяженный гидрофобный линкер, соединяющий два аминокислотных фрагмента, что позволяет усилить рибонуклеазную активность соединений.
Соединения (1) и (2) общей формулы [nAK]2 L были получены по общей схеме, представленной на фиг.3.
Процесс получения соединений (1) и (2) включает в себя реакцию коммерчески доступных активированных эфиров (N-гидроксисукцинимидные и n-нитрофениловые) аминокислот (соединения 6, 10, 11, 12). Схема синтеза соединений (1) и (2) представлена на фиг.4, 5, где L - 1,12-додекандиамин, AHA - 6-аминогексановая кислота, Glu - глутаминовая кислота, Lys - лизин, Вос - трет-бутилоксикарбонильная защитная группа, Z(2C1) - 2-хлорбензилоксикарбонильная защитная группа, Bzl - бензильная защитная группа, ТФУ - трифторуксусная кислота.
Введение трет-бутилоксикарбонильной защиты по аминогруппе 6-аминогексановой кислоты и синтез активированных эфиров проводили согласно стандартным методикам (А.А.Гершкович, В.К.Кибирев. Синтез пептидов. Реагенты и методы. Киев. Наукова думка. 1987).
Данная схема включает в себя реакцию коммерчески доступного 1,12-додекандиамина (3) с защищенной аминокислотой (AK-D), с образованием дизамещенного производного защищенных аминокислот (D-AK)2L, которое далее освобождали от защитных групп. В случае соединения (2) получающиеся концевые аминогруппы первой аминокислоты использовались для введения второй и третьей аминокислоты по такой же схеме. В результате реакции с высокими выходами образуется продукт, содержащий одну (три) аминокислоты, димеризованные с помощью додецильного линкера (L).
Спектры ЯМР записаны на спектрометрах «Bruker AM-400» и «Bruker AV-300» (Германия)» в CD3OD, (CD3 )2СО («Aldrich», США). Для 1Н ЯМР-спектров использовали тетраметилсилан или сигналы остаточных протонов растворителей в качестве внутреннего стандарта. Химические сдвиги приведены в шкале , м.д.
Масс-спектры высокого разрешения получали с помощью MALDI-TOF (time-of-flight) масс-спектрометра Bruker reflex III MALDI TOF (Bruker Analytical Systems, Inc., Германия).
Для колоночной хроматографии использовали силикагель Kieselgel 60 (63-100 мкм, «Merck», Германия).
Для изучения рибонуклеазной активности соединений использовали 96-звенный фрагмент РНК вируса иммунодефицита человека HIV1 и синтетический олигорибонуклеотид ON21, r(UCGAAUUUCCACAGAAUUCGU), который был синтезирован фосфитамидным методом на синтезаторе ASM-102U (ТОО "БИОССЕТ", Новосибирск) и очищен ионообменной и обращеннофазовой хроматографией или препаративным электрофорезом в денатурирующих условиях. Чистоту олигонуклеотида проверяли с помощью электрофореза в 15% ПААГ в денатурирующих условиях, визуализацию олигонуклеотида в геле проводили с помощью окраски Stains-All. Фрагмент РНК был получен с помощью реакции транскрипции in vitro согласно опубликованному протоколу (Maniatis Т., Fritsch E. F., Sambrook J. Molecular cloning. A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989).
Рибонуклеазная активность соединений (1) и (2) была исследована в реакции расщепления in vitro двух РНК-субстратов - олигорибонуклеотида ON21 и РНК96, а антивирусная и мембранолитическая активности этих соединений - в экспериментах по инактивации РНК содержащих вирусов (вирус гриппа и вирус клещевого энцефалита) и в экспериментах по репродукции этих вирусов в культуре эукариотических клеток in vitro.
Сопоставительный анализ заявляемых соединений с известными и широко используемыми соединениями, такими как формалин, УФ-свет или мономерный или бинарный этиленимин (Budowsky. E.I., et al., Vac. Res., 1996, 5, 29-39), показал, что предлагаемые соединения обладают следующими преимуществами.
1) Заявляемые соединения обладают одновременно рибонуклеазной, мембранолитической и антивирусной активностями, что позволяет рассматривать их как перспективные лекарственные агенты.
2) Заявляемые соединения малотоксичны для человека и не требуют особых мер предосторожности (противогаз, перчатки, работа под вытяжкой) при работе с ними. Кроме того, эти соединения стабильны при хранении в виде концентрированных водных растворов или растворов в апротонных растворителях, таких как диметилсульфоксид.
3) Заявляемые соединения не оказывают побочного действия на белковые компоненты вирионов, что не снижает иммуногенные свойства инактивированных вирусов и улучшает свойства получаемых на их основе вакцин.
Поиск по источникам научно-технической и патентной литературы показал, что производные лизина, глутаминовой и 6-аминогексановой кислот общей формулы [nAK]2L, обладающие одновременно рибонуклеазной, мембранолитической и противовирусной активностями, в известных источниках не описаны.
Изобретение иллюстрируется следующими примерами.
Пример 1. Получение N,N'-бис(глутамил)-1,12-додекандиамина (1).
Схема синтеза соединения (1) представлена на фиг.4.
К раствору 1,12-додекандиамина (3) (2.1 ммоль, 0.42 г) и этилдиизопропиламина (4.4 ммоль, 0.75 мл) в 10 мл этилацетата добавляли при перемешивании раствор n-нитрофенилового эфира N -трет-бутилоксикарбонил-О-бензил-L-глутаминовой кислоты (6) (4.4 ммоль, 2.01 г) в 5 мл этилацетата. Реакционную смесь перемешивали 24 ч при 22°С. Затем в реакционную смесь добавляли N,N-диметилэтилендиамин (1 ммоль, 110 мкл) и перемешивали 30 мин. Реакционную смесь промывали последовательно 2%-ным раствором лимонной кислоты (20 мл), водой (20 мл), насыщенным раствором NaHCO3 (20 мл) и водой (20 мл). Органический слой сушили безводным Na2SO4. Растворитель удаляли в вакууме. Остаток сушили в вакууме. Очистку проводили с помощью хроматографии на силикагеле, элюируя продукт в градиенте концентрации этанола в хлористом метилене от 0 до 5%. Фракции, содержащие целевое соединение, упаривали и сушили в вакууме. Выход N,N'-бис((N -трет-бутилоксикарбонил-O-бензил)глутамил)-1,12- додекандиамина (4) 0.86 г, 49.0%.
Данные 1Н ЯМР-спектра для N,N'-бис((N -трет-бутилоксикар6онил-O-бензил)глутамил)-1,12-додекандиамина ((CD3)2СО) , м.д. (J/Гц): 1.27 (м, 16Н, [-NH-(CH2) 2-(CH2)8-(CH2)2 -NH-]L); 1.41 (с, 18Н, [CH3]Boc ); 1.49 (м, 4Н, [-NH-CH2CH2-]L ); 1.86-2.17 (м, 4Н, [CHCH2CH2]Glu, Glu'); 2.48 (т, 4Н, [CHCH2CH2 ]Glu, Glu', J=7.5); 3.22 (м, 4Н, [-NH-CH2 CH2-]L); 4.13 (м, 2Н, CHCH2CH 2]Glu, Glu'); 5.13 (с, 4Н, [CH2 ]Bzl); 7.37 (м, 10Н,
[CH]аром ).
N,N'-бис ((N -трет-бутилоксикарбонил-О-бензил) глутамил)-1,12-додекандиамин (4) растворяли в смеси ТФУ:CH2Cl2=1:1 (5 мл) и выдерживали реакционную смесь 1 ч при комнатной температуре. Растворитель и ТФУ удаляли в вакууме, остаток упаривали с этанолом (3×10 мл), растворяли в CH2Cl2 (5 мл) и высаживали 10-кратным объемом серного эфира. Выдерживали ночь в холодильнике. Эфир декантировали, твердый остаток сушили в вакууме. Выход трифторацетата N,N'-бис(( -бензил)-глутамил)-1,12-додекандиамина (5) 0.82 г, 92.0%. Данные 1Н ЯМР- спектра для N,N'-бис(( -бензил)-глутамил)-1,12-додекандиамина (5) (CDCl3 ) , м.д. (J/Гц): 1.23 (м, 16Н, [-NH-(CH2) 2-(CH2)8-(CH2)2 -NH-]L); 1.49 (м, 4Н, [-NH-CH2CH2 -]L); 2.28-2.38 (м, 4Н, [CHCH2CH2 ]Glu, Glu'); 2.48 (м, 4Н, [CHCH2CH 2]Glu, Glu'); 3.28 (м, 4Н, [-NH-CH2 CH2-]L); 4.16 (м, 2Н, CHCH2CH 2]Glu, Glu'); 5.11 (с, 4Н, [CH2 ]Bzl); 7.34 (м, 10Н, [(CH]аром). MALDI-MS, m/z найдено 639.42 [M+H]+, вычислено 638.40.
Трифторацетат N,N'-бис(( -бензил)-глутамил)-1,12-додекандиамина (5) (0.46 ммоль, 400 мг) растворяли в 5 мл метанола и подвергали гидрогенолизу в присутствии 200 мг 5%-ного Pd/C. По окончании реакции катализатор отфильтровывали, растворитель упаривали в вакууме. Выход N,N'-бис(глутамил)-1,12-додекандиамина (1) после гидрирования 292 мг, 92.2%.
Общий выход N,N'-бис(глутамил)-1,12-додекандиамина (1) в расчете на 1,12-додекандиамин (3) 41.6%.
Данные 1H ЯМР-спектра для N,N'-бис(глутамил)-1,12-додекандиамин трифторацетата (1) ((CD3)2СО) , м.д. (J/Гц): 1.33 (м, 16Н, [-NH-(CH2) 2-(CH2)8-(CH2)2 -NH-]L2); 1.55 (м, 4Н, [-NH-CH2CH2 -]L2); 2.15 (м, 4Н, [CHCH2CH2 ]Glu, Glu'); 2.49 (м, 4Н, [CHCH2CH 2 Glu, Glu'); 3.20-3.36 (м, 4Н, [-NH-CH 2CH2-]L2); 3.90 (т, 2Н, [CHCH 2CH2]Glu, Glu', J=3.6). MALDI-MS, m/z найдено 459.28 [M+H]+, вычислено 458.31.
Пример 2. Получение N,N'-бис(глутамил-6-аминогексаноил-лизил)-1,12-додекандиамина (2).
Схема синтеза соединения (2) представлена на фиг.5.
К раствору 1,12-додекандиамина (3) (2.4 ммоль, 0.48 г) и этилдиизопропиламина (5 ммоль, 0.85 мл) в 10 мл этилацетата добавляли при перемешивании раствор N-гидроксисукцинимидного эфира N -трет-бутилоксикарбонил-N -2-хлорбензилоксикарбониллизина (10) (5 ммоль, 2.6 г) в 5 мл этилацетата. Реакционную смесь перемешивали 24 ч при 22°С. Затем в реакционную смесь добавляли N,N-диметилэтилендиамин (1 ммоль, 110 мкл) и перемешивали 30 мин. Реакционную смесь промывали последовательно 2%-ным раствором лимонной кислоты (20 мл), водой (20 мл), насыщенным раствором NaHCO3 (20 мл) и водой (20 мл). Органический слой сушили безводным Na2SO 4. Растворитель удаляли в вакууме. Полученную пену сушили в вакууме. Выход N,N'-бис((N -трет-бутилоксикарбонил-N -2-хлорбензилоксикарбонил)лизил)-1,12-додекандиамина (7) 1.38 г, 57.9%. Данные 1Н ЯМР-спектра для N,N'-бис((N -трет-бутилоксикарбонил-N -2-хлорбензилоксикарбонил)лизил)-1,12-додекандиамина (7) ((CD3)2СО) , м.д. (J/Гц): 1.29 (м, 16Н, [-NH-(CH2) 2-(CH2)8-(CH2)2 -NH-]L); 1.41 (с, 18Н, [CH3]Boc ); 1.57 (м, 8Н, [-NH- CH2CH2-(СН2 )8-]L, [-CHCH2CH2 (СН2)2]Lys, Lys'); 1.64 (м, 4Н, [-СН(СН2)2CH2CH 2]Lys, Lys'); 1.79 (м, 4Н, [-CHCH2 (CH2)2CH2]Lys, Lys' ); 3.18 (м, 8Н, [-СН(СН2)3CH2 ]Lys, Lys', 4Н, [-NH-CH2CH2 -(CH2)8-]L); 4.05 (м, 2Н, [-CH(СН 2)4]Lys, Lys'); 5.17 (с, 4Н, [CH2]Z(2Cl); 7.35 (м, 4Н, [CH]аром ); 7.44 (м, 2Н, [CH]аром.); 7.50 (м, 2Н, [CH] аром.).
N,N'-бис((N -трет-бутилоксикарбонил-N -2-хлорбензилоксикарбонил) лизил)-1,12-додекандиамин (7) растворяли в смеси ТФУ:CH2Cl2=1:1 (5 мл) и выдерживали реакционную смесь 1 ч при комнатной температуре. Растворитель и ТФУ удаляли в вакууме, остаток упаривали с этанолом (3×10 мл), растворяли в этилацетате (15 мл) и промывали насыщенным раствором NaHCO3 (10 мл) и водой (10 мл), сушили над безводным Na2SO4. Растворитель удаляли в вакууме. Полученный маслообразный остаток сушили в вакууме и использовали в дальнейшем без дополнительной очистки.
Затем аналогично повторяли процедуру конденсации аминокомпоненты последовательно с N-гидроксисукцинимидным эфиром N -трет-бутилоксикарбонил-6-аминогексановой кислоты (11) и N -трет-бутилоксикарбонил-О-бензил-L-глутаминовой кислоты (12) в ДМФА.
Выход N,N'-бис(N -трет-бутилоксикарбонил-6-аминогексаноил-N -2-хлорбензилоксикарбонил)лизил)-1,12-додекандиамина (8) 0.54 г, 49.0%. Данные 1Н ЯМР-спектра для ((8) (CD3OD) , м.д. (J/Гц): 1.30 (м, 16Н, [-NH-(CH2) 2-(CN2)8-(CH2)2 -NH-]L); 1.44 (с, 18Н, [CH3]Boc ); 1.50 (м, 12Н, [-NH- CH2CH2-(СН2 )8-]L, [-CHCH2CH2 CH2)2]Lys, Lys', [-С(O)-(СН 2)2-CH2-(СН2)2 -NH]AHA, AHA'); 1.63 (м, 8H, [-СН(СН2 )2CH2CH2]Lys, Lys' , [-С(O)-(СН2)3-CH2-СН2 - NH]AHA, AHA'); 1.73 (м, 4H, [-С(O)-СН2 -CH2-(СН2)3-NH]AHA, AHA' ); 1.87 (м, 4Н, [-CHCH2(СН2)3 ]Lys, Lys'); 2.25 (т, 4Н, [-C(O)-CH2 -(CH2)4-NH]AHA, AHA', J=7.4); 3.03 (м, 4Н, [-C(O)-(CH2)4-CH2 -NH]AHA, AHA'); 3.15 (м, 8Н, [-CH(СН2 )3CH2 Les, Lys', 4Н, [-NH-CH2CH 2-(CH2)8-]L); 4.27 (м, 2Н, [-CH(СН2)4]Lys, Lys' ); 5.19 (с, 4Н, [CH2]Z(2Cl)); 7.33 (м, 4Н, [CH]аром.); 7.41 (м, 2Н, [CH]аром.); 7.45 (м, 2Н, [CH]аром.).
Выход N,N'-бис((N -трет-6утилоксикарбонил-O-бензил)глутамил-аминогексаноил-N -2-хлорбензилоксикарбонил)лизил)-1,12-додекандиамина (9) 0.07 г, 6.1%. Данные 1H ЯМР-спектра для ((9) (CD 3OD) , м.д. (J/Гц): 1.33 (м, 16Н, [-NH-(CH2) 2-(CH2)8-(CH2)2 -NH-]L); 1.44 (м, 22Н, [CH3]Boc , [-NH-CH2CH2-(CH2)8 -]L); 1.53 (м, 12Н, [-CH(CH2)2 CH2CH2]Lys, Les', [-С(О)- (CH2)2-CH2-(CH2) 2-NH]AHA, AHA'), [-C(O)-(CH2) 3-CH2-CH2-NH]AHA, AHA' ); 1.64 (м, 12Н, [-CHCH2CH2(СН2 )2]Lys, Les', [-C(O)-CH2 -CH2-(CH2)3-NH]AHA, AHA' , [-CHCH2CH2]Glu, Glu'); 1.92 (м, 4Н, [-CHCH2(CH2)3] Lys, Lus'); 2.13 (м, 4Н, [-С(О)-CH2-(CH 2)4-NH]AHA, AHA'; 2.25 (м, 4Н, [-CHCH2CH2]Glu, Glu'); 2.50 (м, 4Н, [-СН(СН2)3CH2]Lys, Lys'); 3.17 (м, 4Н, [-C(O)-(CH2)4 -CH2-NH]AHA, AHA'); 3.40 (м, 4Н, [-NH-CH 2CH2-(CH2)8-]L ); 4.05 (м, 2Н, [-CHCH2CH2]Glu, Glu' ); 4.16 (м, 2Н, [-CH(СН2)4]Lys, Lus' ); 5.12 (с, 4Н, [CH2]Z(2Cl); 7.35 (м, 18Н, [CH]аром.).
N,N'-бис((O-бензил)глутамил-аминогексаноил-(N -2-хлорбензилоксикарбонил)лизил)-1,12-додекандиамин (0.042 ммоль, 70 мг) растворяли в 5 мл метанола и подвергали гидрогенолизу в присутствии 50 мг 5%-ного Pd/C. По окончании реакции катализатор отфильтровывали, растворитель упаривали в вакууме. Выход N,N'-глутамил-аминогексаноил-лизил-1,12-додекандиамин трифторацетата (2) после гидрирования 38.4 мг, 66.2%.
Общий выход N,N'-бис(глутамил-аминогексаноил-лизил)-1,12-додекандиамин трифторацетата (2) в расчете на 1,12-додекандиамин составил 1.7%.
Данные 1Н ЯМР-спектра для N,N'-бис(глутамил-аминогексаноил-лизил)-1,12-додекандиамин трифторацетата (2) (CD3OD) , м.д. (J/Гц): 1.33 (м, 24Н, [-NH-(CH2) 2-(CH2)8-(CH2)2 -NH-]L, [-CHCH2CH2(CH2 )2]Lys, Lys', [-C(O)-(CH2 )2-CH2-(CH2)2-NH] AHA, AHA'); 1.44 (м, 4Н, [-NH-CH2CN 2-(CH2)8-]L; 1.58 (м, 8Н, [-CH(СН2)2CH2CH2 ]Lys, Lys' [-C(O)-(CH2)3 -CH2-CH2-NH]AHA, AHA'); 1.66 (м, 8Н, [-C(O)-CH2-CH2-(CH2 )3-NH]AHA, AHA'), [-CHCH2 CH2]Gly, Glu'); 1.84 (м, 4Н, [-CHCH 2(СН2)3]Lys, Lys'); 2.17 (м, 4Н, [-C(O)-CH2-(CH2)4 -NH]AHA, AHA'); 2.37 (м, 4Н, [-CHCH2 CH2]Glu, Glu'); 2.47 (м, 4Н, [-СН(СН 2)3CH2]Lys, Lys'); 2.56 (м, 4Н, [-С(O)-(СН2)4-CH2 -NH]AHA, AHA'); 2.94 (м, 4Н, [-NH-CH2 CH2-(CH2)8-]L; 3.88 (м, 2Н, [-CHCH2CH2]Glu, Glu' ); 4.10 (м, 2Н, [-CH(CH2)4]Lys, Lys' ). MALDI-MS, m/z найдено 963.27 [M+Na]+, вычислено 940.67.
Пример 3. Расщепление РНК соединениями (1) и (2).
Эксперименты по расщеплению РНК данными соединениями проводили в следующих условиях: стандартная реакционная смесь объемом 10 мкл содержала 10000 имп/мин по Черенкову [5'- 32Р]-меченого ON21 (стабилизированного немеченым ON21 в концентрации 5×10-6 М) или [5'-32 Р]-РНК96, одно из соединений (1) или (2) в концентрациях от 10 -6 до 10-3 М и 50 мМ Tris-HCl рН 7.0, содержащий 0.2 М KCl, 0.5 мМ EDTA.
Реакции проводили при 37°С в течение 1 - 20 ч и останавливали путем осаждения продуктов реакции 10 объемами (100 мкл) 2%-ного раствора LiClO 4 в ацетоне. Осадок РНК и продуктов ее расщепления отделяли центрифугированием, растворили в 5 мкл буфера для нанесения на гель. Продукты расщепления РНК анализировали электрофорезом в 15%-ном ПААГ, содержащем 8 М мочевину. Гель после электрофореза высушивали, и анализировали с помощью прибора фосфоримиджер "Molecular Imager FX" Степень расщепления РНК определяли как отношение количества радиоактивности в полосе, соответствующей продукту расщепления, к общей радиоактивности, нанесенной на дорожку.
При установлении зависимости степени расщепления РНК от концентрации соединений (1) и (2) было обнаружено, что для обоих соединений степень расщепления повышается при повышении концентрации соединений. Оба соединения проявляли наибольшую рибонуклеазную активность при концентрации 1 мМ. В таблице 1 представлены данные по влиянию концентрации соединений (1) и (2) на степень расщепления РНК.
Таблица 1 | ||
Зависимость степени расщепления РНК от концентрации соединений (1) и (2) за 3 часа. Выделенные значения соответствуют наибольшей степени расщепления РНК данным соединением. | ||
Концентрация, мМ | Степень расщепления РНК, % | |
(1) | (2) | |
0.05 | 11 | 13 |
0.1 | 11 | 16 |
0.2 | 35 | 20 |
0.5 | 67 | 29 |
0.7 | 77 | 41 |
1 | 82 | 54 |
При установлении зависимости степени расщепления РНК соединениями (1) и (2) от времени выяснилось, что степень расщепления линейно возрастает на участке от 1 до 5 ч, а через 7 ч инкубации в расщепляемой смеси остается не более 5-10% исходной РНК (Таблица 2). На линейном участке кинетической кривой по уравнению [P]t=[Р] ×(1-e-Kobs×t), где [P]t и [Р] - степени расщепления субстрата за время t и за бесконечное время (можно принять, что за бесконечное время субстрат будет расщеплен на 100%), были найдены константы скорости реакции kobs, равные 0.273 и 0.408 ч-1 для соединений (1) и (2) соответственно.
Таблица 2 | ||
Зависимость степени расщепления РНК в присутствии соединений (1) и (2) в оптимальной концентрации от времени. | ||
Время, ч | Степень расщепления РНК, % | |
(1) | (2) | |
0 | 0 | 0 |
1 | 26 | 20 |
3 | 77 | 58 |
7 | 94 | 87 |
18 | 96 | 95 |
Приведенные примеры подтверждают высокую рибонуклеазную активность соединений (1) и (2).
Пример 4. Влияние соединений (1) и (2) на жизнеспособность клеток MDCK
Клетки линии MDCK (клетки почек собаки) культивировали в среде IMDM, содержащей 10%-ную эмбриональную телячью сыворотку, антибиотики (100 ед./мл пенициллина и 0.1 мг/мл стрептомицина) и антимикотик амфотерицин (0.25 мкг/мл), в атмосфере 5%-ного CO2 при 37°С.
Жизнеспособность клеток после инкубации с соединениями (1) или (2) определяли с помощью МТТ теста, который основан на способности живых клеток превращать соединения на основе тетразола (МТТ) в ярко окрашенные кристаллы формазана, что позволяет спектрофотометрически оценивать количество живых клеток в препарате. Для этого клетки высаживали в 96-луночные планшеты (104 клеток на лунку). Через 24 ч в лунках меняли среду и к клеткам добавляли водный раствор соединения (1) или (2) в воде до конечной концентрации в среде от 10-8 до 10-4 М. Клетки инкубировали в присутствии соединений еще в течение суток в тех же условиях. По окончании инкубации без смены среды к клеткам добавляли раствор МТТ (5 мг/мл) в фосфатно-солевом буфере до концентрации 0.5 мг/мл и инкубировали в течение 3 ч в тех же условиях. Среду удаляли, к клеткам добавляли по 100 мкл диметилсульфоксида, в котором происходит растворение образовавшихся в клетках кристаллов формазана, и измеряли оптическую плотность на многоканальном спектрофотометре на длинах волн 570 и 630 нм, где А570 - поглощение формазана, а А630 - фон клеток.
Из экспериментальных данных вычисляли значение IC50 -концентрацию соединений, при которой наблюдается гибель 50% клеток. Значения IC50 приведены в таблице 3.
Таблица 3 | |
Значения IC50 соединений (1) и (2) для клеток MDCK | |
Соединение | IC50, мМ |
(1) | >5 |
(2) | >5 |
Из приведенных данных видно, что обработка клеток соединениями (1) или (2) вызывает их эффективную гибель только при концентрациях соединений выше 5 мМ, что свидетельствует о чрезвычайно низкой токсичности соединений.
Пример 5. Инактивация вируса гриппа соединениями (1) и (2)
Вирулицидную активность искусственных рибонуклеаз (1), (2) изучали на модели вируса гриппа A/WSN/33, (H1N1). В этих экспериментах использовали вирус гриппа A/WSN/33, (H1N1) с инфекционным титром 106 фокус-образующих единиц (ФОЕ) вируссодержащего материала. Инфекционную активность вируса определяли методом ФОЕ на клетках MDCK. В основе метода лежит модифицированная иммуноферментная реакция: вирусные белки, экспрессирующиеся в инфицированных вирусом клетках, специфически связываются с моноклональными антителами, мечеными ферментом. Далее фермент взаимодействует с субстратом, что приводит к окрашиванию инфицированной клетки. Инактивацию вируса гриппа соединениями (1), (2) проводили при 37°С в 50 мМ буфере Трис-HCl, рН 7.0, содержащем 0.2 M KCl и 2 мМ EDTA, в течение 18 ч при 37°С при концентрациях соединений (1), (2) от 200 мкМ до 4 мМ.
Соединения (1), (2) эффективно инактивируют вирус гриппа, причем степень инактивации вируса увеличивается с повышением концентрации соединений, при которой проводится инактивация вируса. Так, инкубация вируса в течение 18 ч при 37°С с соединениями (1), (2) в концентрации 200 мкМ, снижает титр вируса на 0.8 lg по сравнению с контролем. При увеличении концентрации соединений (1), (2) до 2 мМ наблюдается полная инактивация вируса гриппа (таблица 4). Следует отметить, что концентрация соединений (1) и (2), при которой наблюдается полная инактивация вируса гриппа, значительно ниже, чем значение IC50 для этих соединений.
Пример 6. Инактивация вируса клещевого энцефалита (КЭ) соединениями (1) и (2).
Вирулицидную активность соединений (1), (2) изучали на модели вируса КЭ (штамм Софьин) с инфекционным титром 106 бляшко-образующих единиц (БОЕ). Инфекционную активность вируса КЭ определяли на клетках СПЭВ. Инактивацию вируса КЭ соединениями (1), (2) проводили при концентрации соединений 2 мМ в 50 мМ буфере Трис-HCl, рН 7.0, содержащем 0.2 M KCl и 2 мМ EDTA, в течение 18 ч при 37°С.
Соединения (1), (2) в этих условиях (концентрация 2 мМ, 18 ч, 37°С) полностью инактивируют вирус КЭ (таблица 4).
Инкубация клеток, инфицированных вирусом КЭ с соединением (2) в концентрации 1 мМ, приводила к снижению репродукции вируса на порядок, по сравнению с контролем.
Полученные результаты однозначно свидетельствуют о высокой антивирусной активности соединений (1), (2).
Таблица 4 | ||||
Вирулицидное действие соединений (1), (2). | ||||
Соединение | Вирус гриппа | Вирус КЭ | ||
Концентрации соединений, использованные для инактивации вируса | Титр вируса при инкубации 18 ч при 37°С, lg (ФОЕ/мл) | Концентрации соединений, использованные для инактивации вируса | Титр вируса при инкубации 18 ч при 37°С, lg (БОЕ/мл) | |
(1) | 2 мМ | <1 | 2 мМ | <1 |
(2) | 2 мМ | <1 | 2 мМ | <1 |
контроль | - | 5,2 | - | 4,2 |
Пример 7. Исследование мембранолитической активности соединений (1) и (2)
Исследование морфологии вирусных частиц после инкубации с соединениями (1) и (2) проводили с помощью электронной микроскопии методом негативного контрастирования. Исследуемые образцы сорбировали на опорные электронно-микроскопические сетки, покрытые формоваровой пленкой, в течение 1.5 минут, остаток жидкости убирали, сетку высушивали и помещали в контрастирующий раствор (2%-ный раствор фосфорно-вольфрамовой кислоты в дистиллированной воде) на 45 сек, остаток раствора убирали, сетку высушивали. Образцы (4-6 сеток) изучали в трансмиссионном электронном микроскопе Hitachi-H800 при увеличениях от 10000 до 200000.
Электронно-микроскопическое исследование морфологии вирусных частиц, инактивированных соединениями (1) и (2) выявило вирионы с поврежденной липидной оболочкой, у небольшой части вирусных частиц также наблюдали изменение толщины липидного слоя, пепломеры на поверхности вирусной оболочки были сохранены. Степень повреждения структуры вирионов прямо зависела от концентрации соединений (1) и (2). По мере возрастания концентрации соединений до 10 -3 М происходило развитие повреждений их структуры.
На фиг.6 представлены электронные микрофотографии частиц вируса гриппа, где на снимке 1 - интактный вирус (на поверхности сферической частицы видны пепломеры, оболочка не повреждена), на снимках 2-4 - вирус гриппа, обработанный искусственной рибонуклеазой в стандартных условиях (на поверхности частиц видны пепломеры, разрывы оболочки, частицы деформированы) Негативное контрастирование ФВК. Длина масштабной линии 50 нм.
На основании результатов электронно-микроскопических исследований можно предполагать, что соединения (1) и (2) дезинтегрируют липидные оболочки вирионов, что способствует быстрой инактивации вируса.
Таким образом, полученные данные однозначно указывают на высокую рибонуклеазную, мембранолитическую и антивирусную активность соединений (1) и (2), что позволяет использовать их в качестве активных компонентов для разработки лекарственных форм препаратов, предназначенных для лечения вирусных заболеваний.
Класс A61P31/12 противовирусные средства
Класс A61K38/00 Лекарственные препараты, содержащие пептиды
Класс C07C229/02 амино- и карбоксильные группы, связанные с ациклическими атомами углерода одного и того же углеродного скелета