хиральные диацилгидразиновые лиганды для модуляции экспрессии экзогенных генов с помощью экдизон-рецепторного комплекса
Классы МПК: | C07C241/04 получение гидразидов C07C243/38 с ацилирующими карбоксильными группами, связанными с атомами углерода шестичленных ароматических колец C07C281/02 соединения, содержащие любую из групп: или , например карбазаты C07D213/82 в положении 3 C07D307/68 атомы углерода, связанные тремя связями с гетероатомами (из которых одна может быть с галогеном) C07D317/68 атомы углерода, связанные тремя связями с гетероатомами (из которых одна может быть с галогеном) C07D319/18 этилендиоксибензолы, не замещенные в гетероциклическом кольце C07D333/38 атомы углерода, связанные тремя связями с гетероатомами (из которых одна может быть с галогеном), например с эфирными или нитрильными группами C12N15/09 метод рекомбинантных ДНК A61K31/166 имеющие атом углерода карбоксамидной группы, непосредственно связанный с ароматическим кольцом, например прокаинамид, прокарбазин, метоклопрамид, лабеталол A61K31/27 карбаминовой или тиокарбаминовой кислот, например мепробамат, карбахол, неостигмин A61K31/341 не конденсированные с другим кольцом, например ранитидин, фуросемид, буфетолол, мускарин A61K31/357 имеющие два или более атома кислорода в одном кольце, например, кронэфиры, гуанадрел A61K31/36 соединения, содержащие метилендиоксифенильные группы, например сезамин A61K31/381 содержащие пятичленные кольца A61K31/44 не конденсированные пиридины; их гидрированные производные их |
Автор(ы): | ХОРМАНН Роберт И. (US), ЛИ Бинг (US) |
Патентообладатель(и): | Интрексон Корпорейшн (US) |
Приоритеты: |
подача заявки:
2008-05-29 публикация патента:
20.08.2013 |
Изобретение относится к соединениям общей Формулы III и их фармацевтически приемлемым солям, где А представляет собой (C1-С6)алкил-O-, фенил-(С1 -С6)алкил-O-; арил, выбранный из фенила, нафтила, и , который возможно замещен 1-3 заместителями, указанными в формуле изобретения; или гетероарил, имеющий четыре или пять атомов углерода и один гетероатом, выбранный из кислорода, азота и серы, который возможно замещен 1-3 заместителями, указанными в формуле изобретения; В представляет собой фенил, возможно замещенный 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (С1-С 6)алкила, (С3-С7)циклоалкила, (С 1-С6)алкил-О-, гидрокси, амино и галогено; и R1 и R2 независимо представляют собой (С 1-С6)алкил, фенил-(С1-С6 )алкил-, гидрокси-(С1-С6)алкил, (С 3-С7)циклоалкил, (С2-С6 )алкенил или (С2-С6)алкинил; при условии, что R1 отличается от R2; где абсолютной конфигурацией асимметрического атома углерода, несущего R 1 и R2, преимущественно является R-конфигурация. Также изобретение относится к фармацевтической композиции, обладающей способностью модулировать экспрессию генов, способам модуляции экспрессии гена в клетке-хозяине, способу регуляции экспрессии эндогенного или гетерологичного гена у трансгенного субъекта, способу регуляции трансгенной экспрессии у трансгенного субъекта, способу продуцирования полипептида и к способу получения соединения Формулы IV. Способ включает стадии: а) взаимодействие соединения Формулы V с соединением Формулы VI с получением соединения Формулы VII, б) восстановление соединения Формулы VII с получением соединения Формулы VIII, в) взаимодействие соединения Формулы VIII с соединением Формулы B-CO-LG, где В имеет значения, указанные выше, и LG является уходящей группой, представляющей собой -F, -Cl или -Br, с образованием соединения Формулы IX, г) удаление группы R7CO 2- из соединения Формулы IX с получением соединения Формулы X, д) взаимодействие соединения Формулы Х с соединением Формулы A-CO-LG, где А имеет значения, указанные выше, и LG является уходящей группой, представляющей собой -F, -Cl или -Br, с получением соединения Формулы IV (соединения формул V, VI, VII, VIII, IX, Х представлены в формуле изобретения). Технический результат - соединения Формулы III, обладающие способностью модулировать экспрессию генов. 9 н. и 10 з.п. ф-лы, 4 сx., 25 ил., 2 табл., 78 пр.
Формула изобретения
1. Энантиомерно обогащенное соединение Формулы III
,
где А представляет собой (С1-С 6)алкил-O-, фенил-(С1-С6)алкил-O-; арил, выбранный из фенила, нафтила, и , который возможно замещен 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (C1-С6)алкила, (С3 -С7)циклоалкила, (С1-С6)алкил-O-, гидрокси, амино и галогено; или гетероарил, имеющий четыре или пять атомов углерода и один гетероатом, выбранный из кислорода, азота и серы, который возможно замещен 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (C1-С6)алкила, (С 3-С7)циклоалкила, (С1-С6 )алкил-O-, гидрокси, амино и галогено;
В представляет собой фенил, возможно замещенный 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (С1-С6)алкила, (С3 -С7)циклоалкила, (C1-С6)алкил-O-, гидрокси, амино и галогено; и
R1 и R2 независимо представляют собой (С1-С6)алкил, фенил-(С1-С6)алкил-, гидрокси-(С1 -С6)алкил, (С3-С7)циклоалкил, (С2-С6)алкенил или (С2-С 6)алкинил;
при условии, что R1 отличается от R2;
где абсолютной конфигурацией асимметрического атома углерода, несущего R1 и R2, преимущественно является R-конфигурация;
или его фармацевтически приемлемая соль.
2. Соединение по п.1, где
А представляет собой -ОС(СН3)3, -OCH2Ph; арил, выбранный из фенила, нафтила, и который возможно замещен 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (С1-С6)алкила, (С3 -С7)циклоалкила, (С1-С6)алкил-O-, гидрокси, амино и галогено; или гетероарил, имеющий четыре или пять атомов углерода и один гетероатом, выбранный из кислорода, азота и серы, который возможно замещен 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (С1-С6)алкила, (С 3-С7)циклоалкила, (С1-С6 )алкил-O-, гидрокси, амино и галогено;
В представляет собой фенил, возможно замещенный 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (С1-С6)алкила, (С1 -С6)алкил-O- и галогено;
R1 представляет собой (С1-С6)алкил, гидрокси(С1 -С4)алкил или (C2-С6)алкенил; и
R2 представляет собой (С1-С 6)алкил, фенил-(С1-С4)алкил или (С 3-С7)циклоалкил.
3. Соединение по п.2, где
А представляет собой
or ;
R3a, R3b, R3c , R3d и R3e независимо выбраны из водорода, галогено, гидрокси, амино, (С1-С6)алкила, (С3-С7)циклоалкила или (С1-С 6)алкил-O-;
или R3a и R3b , взятые вместе, образуют -ОСН2О- или -ОСН2 СН2О-; или
R3b и R3c , взятые вместе, образуют -ОСН2О- или -ОСН2 СН2О-;
R4a, R4b, R 4c, R5a, R5b, R6a, R 6b и R6c независимо выбраны из водорода, галогено, гидрокси, амино, (С1-С6)алкила, (С 3-С7)циклоалкила или (C1-С6 )алкил-O-;
Х представляет собой О или S; и
В представляет собой
;
R3f, R3g, R3h , R3i и R3j независимо выбраны из водорода, галогено, гидрокси, амино, (С1-С6)алкила, (С3-С7)циклоалкила или (С1-С 6)алкил-O-.
4. Соединение по п.3,
где R 1 представляет собой (С1-С6)алкил, гидрокси(С1-С4)алкил или (C2 -С4)алкенил; и
R2 представляет собой (С1-С6)алкил.
5. Соединение по п.4,
где А представляет собой
;
R3a, R3b, R3c , R3d и R3e независимо выбраны из водорода, галогено, (C1-С4)алкила или (С1 -С4)алкил-O-; и
R3f, R3g , R3h, R3i и R3j независимо выбраны из водорода, галогено, (C1-С4)алкила или (С1-С4)алкил-O-.
6. Соединение по п.1, выбранное из:
(R)-N'-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(3,5-диметилбензоил)гидразинкарбоновой кислоты трет-бутилового эфира;
(R)-N'-(1-трет-бутил-4-гидроксибутил)-N'-(3,5-диметилбензоил)гидразин-карбоновой кислоты бензилового эфира;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2-этил-3-метоксибензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N'-бензоил-N-(1-трет-бутил-бутил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2-метилбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2-метоксибензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2-фторбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2-хлор-бензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N'-(2-бромбензоил)-N-(1-трет-бутил-бутил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(3-метилбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(3-метоксибензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(3-хлорбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(4-метилбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(4-этилбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(4-метоксибензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(4-хлорбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2,6-дифторбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2,6-дихлорбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(3,4-диметоксибензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(3,5-дифторбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(3,5-диметокси-4-метилбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(4-метилбензо[1,3]диоксол-5-карбонил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(5-метил-2,3-дигидробензо[1,4]диоксин-6-карбонил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(5-этил-2,3-дигидробензо[1,4]диоксин-6-карбонил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(нафталин-1-карбонил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(нафталин-2-карбонил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты (N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(тиофен-2-карбонил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2,5-диметилфуран-3-карбонил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2-хлорпиридин-3-карбонил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(6-хлорпиридин-3-карбонил)гидразида;
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(3-метокси-2-метилбензоил)гидразида;
(R)-3,5-диметокси-4-метилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(3-метокси-2-метилбензоил)гидразида или
(R)-3,5-диметилбензойной кислоты N'-(4-этилбензоил)-N-(1-фенетилбут-3-енил)гидразида.
7. (R)-3,5-диметилбензойной кислоты N-(1-трет-бутил-бутил)-N'-(2-этил-3-метоксибензоил)гидразид или его фармацевтически приемлемая соль.
8. Фармацевтическая композиция, обладающая способностью модулировать экспрессию генов, содержащая соединение по любому из пп.1-7 в эффективной дозе и фармацевтически приемлемый носитель.
9. Способ получения соединения Формулы IV
,
где А представляет собой арил, выбранный из фенила, нафтила, и , который возможно замещен 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (С1-С6)алкила, (С3 -С7)циклоалкила, (С1-С6)алкил-O-, гидрокси, амино и галогено, или гетероарил, имеющий четыре или пять атомов углерода и один гетероатом, выбранный из кислорода, азота и серы, который возможно замещен 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (С1-С6)алкила, (С 3-С7)циклоалкила, (С1-С6 )алкил-O-, гидрокси, амино и галогено;
В представляет собой фенил, возможно замещенный 1-3 заместителями, где заместители выбраны из (С1-С6)алкила, (С3 -С7)циклоалкила, (C1-С6)алкил-O-, гидрокси, амино и галогено;
R2 независимо представляет собой (С1-С6)алкил или (С 3-С7)циклоалкил;
при условии, что R 2 не является -CR8R9CHR10 CR11R12; и
R8, R 9, R10, R11 и R12 независимо выбраны из водорода;
где асимметрический атом углерода, к которому присоединяют R2, энантиомерно обогащен или R-, или S-изомером;
включающий:
а) взаимодействие соединения Формулы V
с соединением Формулы VI
,
где Х и Y независимо представляют собой О или NR, где R представляет собой (С1-С6 )алкил;
Са и Cb независимо представляют собой асимметрический атом углерода в S-конфигурации или асимметрический атом углерода в R-конфигурации;
R14 и R 15 независимо представляют собой (С1-С6 )алкил или фенил;
R13 представляет собой галогено;
R7 представляет собой (С1-С6 )алкил, фенил-(С1-С6)алкил или фенил; и
R2, R8, R9, R10 , R11 и R12 имеют значения, указанные выше;
с получением соединения Формулы VII
;
б) восстановление соединения Формулы VII с получением соединения Формулы VIII
;
в) взаимодействие соединения Формулы VIII с соединением Формулы В-CO-LG, где В имеет значения, указанные выше, и LG является уходящей группой, представляющей собой -F, -С1 или -Вг, с образованием соединения Формулы IX
;
г) удаление группы R7CO2 - из соединения Формулы IX с получением соединения Формулы Х
;
и
д) взаимодействие соединения Формулы Х с соединением Формулы А-СО-LG, где А имеет значения, указанные выше, и LG является уходящей группой, представляющей собой -F, -Cl или -Br, с получением соединения Формулы IV.
10. Способ по п.9,
где Х представляет собой NR, и R представляет собой метил;
Y представляет собой О;
R14 представляет собой метил;
R15 представляет собой фенил;
каждый из Са и Cb имеет S-конфигурацию;
В представляет собой 3,5-диметилфенил,
А представляет собой 2-этил-3-метоксифенил, и
R 2 представляет собой трет-бутил.
11. Способ модуляции экспрессии интересующего гена в клетке-хозяине, где указанная клетка-хозяин содержит первую рекомбинантную кассету экспрессии гена, содержащую первый полинуклеотид, кодирующий первый полипептид, содержащий:
1) ДНК-связывающий домен и
2) лиганд-связывающий домен ядерного рецептора группы Н;
и вторую рекомбинантную кассету экспрессии гена, содержащую:
1) элемент ответа, способный связываться с указанным ДНК-связывающим доменом;
2) промотор и
3) указанный интересующий ген;
включающий приведение указанной клетки-хозяина в контакт с соединением по любому из пп.1-7; где указанная экспрессия указанного интересующего гена модулирована.
12. Способ регуляции экспрессии эндогенного или гетерологичного гена у трансгенного субъекта, включающий приведение лиганда в контакт с экдизон-рецепторным комплексом в клетках указанного субъекта, где указанные клетки дополнительно содержат ДНК-связывающую последовательность для указанного экдизон-рецепторного комплекса, когда находятся в комбинации с указанным лигандом, и где образование комплекса «экдизон-рецепторный комплекс-лиганд-ДНК-связывающая последовательность» индуцирует экспрессию гена, и где указанный лиганд представляет собой соединение по любому из пп.1-7; при котором регулируют экспрессию эндогенного или гетерологичного гена у трансгенного субъекта.
13. Способ по п.12, где субъект представляет собой растение.
14. Способ по п.12, где субъект представляет собой человека.
15. Способ по п.12, где указанные клетки являются аутологичными клетками и указанные аутологичные клетки содержат указанный экдизон-рецепторный комплекс и ДНК-связывающую последовательность для экдизонового комплекса, и указанные клетки имплантируют указанному субъекту, чтобы сделать его трансгенным.
16. Способ по п.15, где указанный гетерологичный ген представляет собой IL-12.
17. Способ регуляции трансгенной экспрессии у трансгенного субъекта, где указанный трансгенный субъект содержит рекомбинантный экдизон-рецепторный комплекс, способный регулировать трансгенную экспрессию; включающий введение указанному субъекту эффективного количества соединения по любому из пп.1-7.
18. Способ модуляции экспрессии гена в клетке-хозяине, включающий стадии:
а) введения в указанную клетку-хозяин системы модуляции экспрессии гена, содержащей:
1) первую рекомбинантную кассету экспрессии гена, которая способна экспрессироваться в указанной клетке-хозяине, где указанная первая рекомбинантная кассета экспрессии гена содержит полинуклеотидную последовательность, которая кодирует первый гибридный полипептид, содержащий:
(а) ДНК-связывающий домен, который распознает элемент ответа, ассоциированный с геном, экспрессия которого подлежит модулированию; и
(б) лиганд-связывающий домен экдизонового рецептора;
2) вторую рекомбинантную кассету экспрессии гена, которая способна экспрессироваться в указанной клетке-хозяине, где указанная вторая рекомбинантная кассета экспрессии гена содержит полинуклеотидную последовательность, которая кодирует второй гибридный полипептид, содержащий:
(а) домен трансактивации и
(б) лиганд-связывающий домен химерного ретиноидного Х-рецептора; и
(3) третью рекомбинантную кассету экспрессии гена, способную экспрессироваться в указанной клетке-хозяине, где указанная третья рекомбинантная кассета экспрессии гена содержит полинуклеотидную последовательность, включающую:
(а) элемент ответа, распознаваемый ДНК-связывающим доменом указанного первого гибридного полипептида;
(б) промотор, который активируется доменом трансактивации указанного второго гибридного полипептида; и
(в) ген, экспрессия которого подлежит модулированию; и
б) введение в указанную клетку-хозяин соединения по любому из пп.1-7;
где экспрессия указанного гена в указанной клетке-хозяине модулирована.
19. Способ продуцирования полипептида, включающий стадии:
а) селекции клетки-хозяина, которая является, по существу, нечувствительной к воздействию соединения по любому из пп.1-7;
б) введение в указанную клетку-хозяин:
(1) ДНК-конструкции, содержащей:
(а) экзогенный ген, кодирующий указанный полипептид; и
(б) элемент ответа;
где указанный экзогенный ген находится под контролем указанного элемента ответа; и
(2) ДНК-конструкции, кодирующей экдизон-рецепторный комплекс, содержащий:
(а) ДНК-связывающий домен, который связывается с указанным элементом ответа;
(б) лиганд-связывающий домен экдизонового рецептора и
(в) домен трансактивации; и
в) воздействие указанного соединения на указанную клетку; при котором продуцируется полипептид.
Описание изобретения к патенту
Класс C07C241/04 получение гидразидов
Класс C07C243/38 с ацилирующими карбоксильными группами, связанными с атомами углерода шестичленных ароматических колец
Класс C07C281/02 соединения, содержащие любую из групп: или , например карбазаты
Класс C07D213/82 в положении 3
Класс C07D307/68 атомы углерода, связанные тремя связями с гетероатомами (из которых одна может быть с галогеном)
Класс C07D317/68 атомы углерода, связанные тремя связями с гетероатомами (из которых одна может быть с галогеном)
Класс C07D319/18 этилендиоксибензолы, не замещенные в гетероциклическом кольце
Класс C07D333/38 атомы углерода, связанные тремя связями с гетероатомами (из которых одна может быть с галогеном), например с эфирными или нитрильными группами
Класс C12N15/09 метод рекомбинантных ДНК
Класс A61K31/166 имеющие атом углерода карбоксамидной группы, непосредственно связанный с ароматическим кольцом, например прокаинамид, прокарбазин, метоклопрамид, лабеталол
Класс A61K31/27 карбаминовой или тиокарбаминовой кислот, например мепробамат, карбахол, неостигмин
Класс A61K31/341 не конденсированные с другим кольцом, например ранитидин, фуросемид, буфетолол, мускарин
Класс A61K31/357 имеющие два или более атома кислорода в одном кольце, например, кронэфиры, гуанадрел
Класс A61K31/36 соединения, содержащие метилендиоксифенильные группы, например сезамин
Класс A61K31/381 содержащие пятичленные кольца
Класс A61K31/44 не конденсированные пиридины; их гидрированные производные их