ферментативно отщепляемые линкеры для твердофазных синтезов
Классы МПК: | C07B61/00 Прочие общие способы C07K1/04 на носителях C12P13/04 альфа- или бета-аминокислоты C07C235/12 с атомом азота по меньшей мере одной из карбоксамидных групп, связанным с ациклическим атомом углерода углеводородного радикала, замещенного карбоксильными группами C07C235/66 с атомами углерода карбоксамидных групп, связанными с атомами углерода шестичленных ароматических колец, не входящих в конденсированные циклические системы, и с атомами кислорода с простыми связями, присоединенными к одному и тому же углеродному скелету |
Автор(ы): | ВАЛЬДМАНН Херберт (DE), ЗАУЭРБРАЙ Бернд (DE), ГРЕТЕР Уве (DE) |
Патентообладатель(и): | БАСФ АКЦИЕНГЕЗЕЛЬШАФТ (DE) |
Приоритеты: |
подача заявки:
1997-06-27 публикация патента:
10.02.2003 |
Изобретение относится к ферментативно отщепляемому линкеру, связанному с твердой фазой, выбранной из группы, включающий керамику, стекло, латекс, сшитые поперечными связями полистиролы, сшитые поперечными связями полиакриламиды или другие смолы, природные полимеры, силикагели, аэрогели и гидрогели, на котором по функциональной группе синтезируют органические соединения, причем линкер содержит место, узнаваемое гидролитическим ферментом, и при реакции с ферментом распадается так, что в синтезированном продукте не остается никаких участков молекулы линкера, причем данное место, узнаваемое ферментом, выбрано из группы, включающей сложноэфирные связи, амидокислотные связи, простые эфирные связи, сложноэфирные связи в эфирах фосфорной кислоты и гликозидные связи, и что узнаваемое ферментом место и место, при котором высвобождается продукт синтеза посредством распада линкера, являются различными, а также к способу его получения. 2 с. и 3 з.п. ф-лы.
Рисунок 1, Рисунок 2, Рисунок 3
Формула изобретения
1. Ферментативно отщепляемый линкер, связанный с твердой фазой, выбранной из группы, включающий керамику, стекло, латекс, сшитые поперечными связями полистиролы, сшитые поперечными связями полиакриламиды или другие смолы, природные полимеры, силикагели, аэрогели и гидрогели, на котором по функциональной группе синтезируют органические соединения, отличающийся тем, что линкер содержит место, узнаваемое гидролитическим ферментом, и при реакции с ферментом распадается так, что в синтезированном продукте не остается никаких участков молекулы линкера, причем данное место, узнаваемое ферментом, выбрано из группы, включающей сложноэфирные связи, амидокислотные связи, простые эфирные связи, сложноэфирные связи в эфирах фосфорной кислоты и гликозидные связи, и что узнаваемое ферментом место и место, при котором высвобождается продукт синтеза посредством распада линкера, являются различными. 2. Линкер по п.1, отличающийся тем, что линкер отщепляется от синтезированного на твердой фазе продукта при отщеплении двуокиси углерода. 3. Линкер по п.1 или 2, отличающийся тем, что гидролитический фермент выбран из группы, включающей липазы, эстеразы, амидазы, протеазы, пептидазы, фосфатазы, фосфолипазы, пероксидазы или гликозидазы. 4. Линкер по одному из пп.1-3, отличающийся тем, что он представляет собой соединение общей формулы I
в которой

R - водород, или инертный в условиях реакции остаток, или два соседних инертных остатка R, которые вместе образуют ароматическое, гетероароматическое или алифатическое кольцо;
R1 - замещенный или незамещенный алкил с 1-20 атомами углерода, алкенил с 3-20 атомами углерода, алкинил с 3-6 атомами углерода, алкилкарбонил с 1-20 атомами углерода в алкиле, алкилфосфорил с 1-20 атомами углерода, алкенилкарбонил с 3-20 атомами углерода в алкениле, алкинилкарбонил с 3-6 атомами углерода в алкиниле, алкенилфосфорил с 3-20 атомами углерода, алкинилфосфорил с 3-6 атомами углерода, циклоалкил с 3-20 атомами углерода, циклоалкилкарбонил с 3-20 атомами углерода в циклоалкиле, циклоалкилфосфорил с 3-20 углеродными атомами, арил, арилкарбонил, арилфосфорил гетарил, гетарилкарбонил, гетарилфосфорил, гликозил, замещенные или незамещенные аминокислоты или пептиды;
R2 - нуклеофуг, представляющий собой удаляемую группу, такую, как галоген;
n = 1 или 2. 5. Способ получения ферментативно отщепляемого линкера, связанного с твердой фазой, включающий связывание линкера посредством сложноэфирной связи, простой эфирной связи, амидной связи, аминосвязи, сульфидной или фосфатной фазы с твердой фазой, выбранной из группы, включающей керамику, стекло, латекс, сшитые поперечными связями полистиролы, сшитые поперечными связями полиакриламиды или другие смолы, природные полимеры, силикагели, аэрогели и гидрогели, отличающийся тем, что связыванию с твердой фазой подвергают соединения формулы II

где

R - водород, инертный в условиях реакции остаток или два соседних инертных остатка R, которые вместе образуют ароматическое, гетероароматическое или алифатическое кольцо;
R1 - замещенный или незамещенный алкил с 1-20 атомами углерода, алкенил с 3-20 атомами углерода, алкинил с 3-6 атомами углерода, алкилкарбонил с 1-20 атомами углерода в алкиле, алкилфосфорил с 1-20 атомами углерода, алкенилкарбонил с 3-20 атомами углерода в алкениле, алкинилкарбонил с 3-6 атомами углерода в алкиниле, алкенилфосфорил с 3-20 атомами углерода, алкинилфосфорил с 3-6 атомами углерода, циклоалкил с 3-20 атомами углерода, циклоалкилкарбонил с 3-20 атомами углерода в циклоалкиле, циклоалкилфосфорил с 3-20 углеродными атомами, арил, арилкарбонил, арилфосфорил, гетарил, гетарилкарбонил, гетарилфосфорил, гликозил, замещенные или незамещенные аминокислоты или пептиды;
Х - СОО, О, NR3, S, OPO(OR4)-O, где R3 и R4 независимо друг от друга - водород, алкил с 1-8 атомами углерода;
n = 1 или 2,
и получаемый продукт формулы III

где


подвергают взаимодействию с соединениями формулы IV

где Y и R2 одинаковы или различны и означают нуклеофуг, представляющий собой удаляемую группу, такую, как галоген.
Описание изобретения к патенту
Изобретение относится к ферментативно отщепляемым линкерам для твердофазных синтезов и к способу их получения. Для современного исследования биологически активных веществ разрабатывают множество молекулярных тест-систем, как, например, анализы связывания рецепторов, ферментативные анализы и анализы клеток и клеточных взаимодействий. Автоматизация и миниатюризация этих тест-систем делают возможным тестирование все большего числа химических соединений на их биологическое действие при случайном скрининге и тем самым на возможное применение в качестве требуемой структуры для биологически активного вещества в медицине, ветеринарии или для защиты растений. Классическая синтетическая химия превратилась в результате этих разработок в лимитирующий фактор в исследованиях по поиску биологически активных веществ. Когда полностью используется производительность разработанных тест-систем, эффективность химического синтеза биологически активного вещества должна значительно повыситься. Такому требуемому повышению эффективности может способствовать комбинаторная химия, в частности, когда она использует автоматизированные методы твердофазного синтеза (см., например, обзор в J.Med.Chem. 1994, 37, 1233 и 1994, 37, 1385). Принцип таких комбинаторных синтезов заключается в том, что на каждом этапе синтеза реакция проходит не только с одним структурным элементом, а с несколькими либо параллельно, либо в смеси. На каждом этапе образуются все возможные комбинации таким образом, что при относительно малом числе структурных звеньев уже после нескольких стадий возникает большое число продуктов, так называемая библиотека субстанций. Твердофазный синтез имеет то достоинство, что легко могут быть удалены побочные продукты и избыточные реагенты, так что не требуется никакой очистки продуктов. При большом избытке растворенного, участвующего в реакции вещества реакции ускоряются и могут быть оптимизированы. Готовые продукты синтеза могут подвергаться массовому скринингу непосредственно, то есть соединенными с носителем, или после отщепления твердой фазы. Промежуточные продукты также могут испытываться при массовом скрининге. Ранее описанные применения ограничивались в основном областью пептидов и нуклеотидов (Lebl и др., Int. J. Pept. Prot. Res. 41, 1993: 203 и международная заявка на патент 92/00091) или их производными (международная заявка на патент 96/00391). Поскольку пептиды и нуклеотиды в качестве фармацевтических препаратов применимы только ограниченно из-за их неблагоприятных фармакологических свойств, желательно использовать известные из химии пептидов и нуклеотидов испытанные способы твердофазного синтеза для синтетической органической химии. В патенте США 5288514 сообщается об одном из первых комбинаторных твердофазных синтезов в органической химии не в области химии пептидов и нуклеотидов. Патент США 5288514 описывает последовательный твердофазный синтез 1,4-бензодиазепинов. В международных заявках на патенты 95/16712, 95/30642 и 96/00148 описываются другие твердофазные синтезы потенциальных биологически активных веществ в комбинаторной химии. Чтобы можно было полностью использовать возможности современных тест-систем для массового скрининга, необходимо, однако, подвергать постоянно массовому скринингу новые соединения по возможности с большими структурными различиями. Такой подход позволяет значительно уменьшить время на идентификацию и оптимизацию новой основной структуры биологически активного вещества. Поэтому необходимо постоянно разрабатывать новые различные комбинаторные твердофазные синтезы. Для этих новых синтезов важно, чтобы отдельные структурные элементы твердофазного синтеза оптимально друг с другом взаимодействовали. Посредством выбора твердой фазы, как, например, стекло, керамика или смола, а также линкера оказывается решающее влияние на последующее проведение химических превращений на носителе. Чтобы можно было осуществить возможно больший спектр органических синтезов на твердой фазе, имеется большая потребность в разработке новых твердых фаз, а также новых линкерных или анкерных групп. До сих пор применялись неустойчивые к основаниям или кислотам линкерные группы, условия отщепления которых являются слишком жесткими для многих синтезируемых на носителе веществ. Поэтому предпринимаются большие усилия, чтобы создать линкеры, которые могут отщепляться от твердой фазы в мягких условиях. При этом было бы желательно, чтобы можно было использовать фермент для отщепления линкера в мягких условиях, как это уже возможно в отдельных случаях для защитных групп. Пример ферментативно отщепляемой защитной группы описывает Waldmann и др. в Angew. Chem. 1995, 107, 20: 2425-2428. Elmore и др. описывают первый ферментативно отщепляемый линкер для твердофазного пептидного синтеза (J. Chem. Soc., Chem. Commun., том 14, 1992: 1033-1034), который может быть отщеплен от носителя в мягких условиях. Другой ферментативно отщепляемый линкер в случае твердофазного синтеза сахаров описывается Schuster и др. (J. Am. Chem. Soc., 1994, 116: 1135-1136 и в патенте США 5369017). Недостатком обоих способов является то, что после ферментативного отщепления в продукте всегда остаются части линкера. Оба способа, кроме того, сильно ограничены ферментом, отщепляющим данный линкер, так Elmore применяет для отщепления фосфодиэстеразу из селезенки теленка, а Schuster и др. описывают применение серинпротеаз для отщепления. Задачей изобретения является разработка отщепляемого в мягких условиях линкера, который лишен указанных выше недостатков и делает возможной широкую палитру органических синтезов на твердой фазе. Поставленная задача решается ферментативно отщепляемым линкером, связанным с твердой фазой, выбранной из группы, включающий керамику, стекло, латекс, сшитые поперечными связями полистиролы, сшитые поперечными связями полиакриламиды или другие смолы, природные полимеры, силикагели, аэрогели и гидрогели, на котором по функциональной группе синтезируют органические соединения за счет того, что линкер содержит место, узнаваемое гидролитическим ферментом, и при реакции с ферментом распадается так, что в синтезированном продукте не остается никаких участков молекулы линкера, причем данное место, узнаваемое ферментом, выбрано из группы, включающей сложноэфирные связи, амидокислотные связи, простые эфирные связи, сложноэфирные связи в эфирах фосфорной кислоты и гликозидные связи, и что узнаваемое ферментом место, при котором высвобождается продукт синтеза посредством распада линкера, являются различными. Поставленная задача также решается способом его получения, который будет более подробно пояснен ниже. Предпочтительный линкер характеризуется общей формулой I
в которой изменяющиеся величины и заместители имеют следующие значения:

R означает водород или инертный в условиях реакции остаток или два соседних инертных остатка R, которые вместе образуют ароматическое, гетероароматическое или алифатическое кольцо,
R1 означает замещенный или незамещенный алкил с 1-20 атомами углерода, алкенил с 3-20 атомами углерода, алкинил с 3-6 атомами углерода, алкилкарбонил с 1-20 атомами углерода в алкиле, алкилфосфорил с 1-20 атомами углерода, алкенилкарбонил с 3-20 атомами углерода в алкениле, алкинилкарбонил с 3-6 атомами углерода в алкиниле, алкенилфосфорил с 3-20 атомами углерода, алкинилфосфорил с 3-6 атомами углерода, циклоалкил с 3-20 атомами углерода, циклоалкилкарбонил с 3-20 атомами углерода в циклоалкиле, циклоалкилфосфорил с 3-20 углеродными атомами, арил, арилкарбонил, арилфосфорил, гетарил, гетарилкарбонил, гетарилфосфорил, гликозил, замещенные или незамещенные аминокислоты или пептиды,
R2 означает нуклеофуг, представляющий собой удаляемую группу, такую как галоген,
n = 1 или 2. Линкерами по изобретению являются линкеры, которые содержат место, узнаваемое гидролитическим ферментом, и при реакции с ферментом распадаются так, что линкер полностью отщепляется от связанного на твердой фазе посредством линкера синтезированного продукта, то есть в синтезированном продукте не остается никаких частей молекулы линкера. Предпочтительно линкер отщепляется от синтезированного на твердой фазе продукта при отщеплении двуокиси углерода. Под местом, узнаваемым ферментом (Е), имеют в виду связь, расщепляемую гидролитическим ферментом. Расщепляемыми гидролитическими ферментами связями являются, например, такие связи, как сложноэфирные, амидокислотные связи, простые эфирные связи, сложноэфирные связи в эфирах фосфорной кислоты или гликозидные связи. В качестве ферментов для расщепления линкера согласно изобретению в мягких условиях годятся гидролитические ферменты, как, например, липазы, эстеразы, амидазы, протеазы, пептидазы, фосфатазы, фосфолипазы, пероксидазы или гликозидазы. Предпочтительно ферменты выбирают из группы, включающей липазы, эстеразы, амидазы, протеазы или гликозидазы, особенно предпочтительны липазы, эстеразы или гликозидазы. Например, линкеры согласно изобретению представлены формулой V (схема А). Схема А

причем заместители и изменяющиеся величины имеют следующие значения:



К - центральная структура линкера,
Z - функциональная группа, при которой высвобождается продукт,
R2 - нуклеофуг, представляющий собой удаляемую группу, с которой связываются целевые продукты. Через центральную структуру линкера соединены узнаваемое ферментом место












- алкенил означает разветвленные или неразветвленные алкенильные остатки с 3-20 углеродными атомами, как, например, пропенил, 1-бутенил, 2-бутенил, 3-бутенил, 2-метилпропенил, 1-пентенил, 2-пентенил, 3-пентенил, 4-пентенил, 1-метил-1-бутенил, 2-метил-1-бутенил, 3-метил-1-бутенил, 1-метил-2-бутенил, 2-метил-2-бутенил, 3-метил-2-бутенил, 1-метил-3-бутенил, 2-метил-3-бутенил, 3-метил-3-бутенил, 1,1-диметил-2-пропенил, 1,2-диметил-1-пропенил, 1,2-диметил-2-пропенил, 1-этил-1-пропенил, 1-этил-2-пропенил, 1-гексенил, 2-гексенил, 3-гексенил, 4-гексенил, 5-гексенил, 1-метил-1-пентенил, 2-метил-1-пентенил, 3-метил-1-пентенил, 4-метил-1-пентенил, 1-метил-2-пентенил, 2-метил-2-пентенил, 3-метил-2-пентенил, 4-метил-2-пентенил, 1-метил-3-пентенил, 2-метил-3-пентенил, 3-метил-3-пентенил, 4-метил-3-пентенил, 1-метил-4-пентенил, 2-метил-4-пентенил, 3-метил-4-пентенил, 4-метил-4-пентенил, 1,1-диметил-2-бутенил, 1,1-диметил-3-бутенил, 1,2-диметил-1-бутенил, 1,2-диметил-2-бутенил, 1,2-диметил-3-бутенил, 1,3-диметил-1-бутенил, 1,3-диметил-2-бутенил, 1,3-диметил-3-бутенил, 2,2-диметил-3-бутенил, 2,3-диметил-1-бутенил, 2,3-диметил-2-бутенил, 2,3-диметил-3-бутенил, 3,3-диметил-1-бутенил, 3,3-диметил-2-бутенил, 1-этил-1-бутенил, 1-этил-2-бутенил, 1-этил-3-бутенил, 2-этил-1-бутенил, 2-этил-2-бутенил, 2-этил-3-бутенил, 1,1,2-триметил-2-пропенил, 1-этил-1-метил-2-пропенил, 1-этил-2-метил-1-пропенил, 1-этил-2-метил-2-пропенил, 1-гептенил, 2-гептенил, 3-гептенил, 4-гептенил, 5-гептенил, 6-гептенил, 1-октенил, 2-октенил, 3-октенил, 4-октенил, 5-октенил, 6-октенил, 7-октенил, ноненил, деценил, ундеценил, додеценил, тридеценил, тетрадеценил, пентадеценил, гексадеценил, гептадеценил, октадеценил, нонадеценил или эйкозенил;
- алкинил означает разветвленные или неразветвленные алкинильные остатки с 2-6 атомами углерода, как, например, этинил, проп-1-ин-1-ил, проп-2-ин-1-ил, н-бут-1-ин-1-ил, н-бут-1-ин-3-ил, н-бут-1-ин-4-ил, н-бут-2-ин-1-ил, н-пент-1-ин-1-ил, н-пент-1-ин-3-ил, н-пент-1-ин-4-ил, н-пент-1-ин-5-ил, н-пент-2-ин-1-ил, н-пент-2-ин-4-ил, н-пент-2-ин-5-ил, 3-метилбут-1-ин-3-ил, 3-метилбут-1-ин-4-ил, н-гекс-1-ин-1-ил, н-гекс-1-ин-3-ил, н-гекс-1-ин-4-ил, н-гекс-1-ин-5-ил, н-гекс-1-ин-6-ил, н-гекс-2-ин-1-ил, н-гекс-2-ин-4-ил, н-гекс-2-ин-5-ил, н-гекс-2-ин-6-ил, н-гекс-3-ин-1-ил, н-гекс-3-ин-2-ил, 3-метилпент-1-ин-1-ил, 3-метилпент-1-ин-3-ил, 3-метилпент-1-ин-4-ил, 3-метилпент-1-ин-5-ил, 4-метилпент-1-ин-1-ил, 4-метилпент-2-ин-4-ил или 4-метилпент-2-ин-5-ил;
- алкилкарбонил означает разветвленные или неразветвленные алкилкарбонильные цепочки с 1-20 атомами углерода в алкиле с алкильными группами, как упомянутые выше для R1, которые присоединены к основе по карбонильной группе [-(С=O)-];
- алкилфосфорил означает разветвленные или неразветвленные алкил-фосфорильные остатки с 1-20 атомами углерода с такими алкильными группами, как вышеупомянутые для R1, которые присоединены к основе по фосфорильной группе [-О-Р(О)(ОН)-];
- алкенилкарбонил означает разветвленные или неразветвленные алкенил-карбонильные цепочки с 3-20 атомами углерода в алкениле с алкенильными группами, как упомянутые выше для R1, которые присоединены к основе по карбонильной группе [-(С=O)-];
- алкенилфосфорил означает разветвленные или неразветвленные, содержащие 3-20 атомов углерода алкенилфосфорильные цепочки с алкенильными группами, как упомянутые выше для R1, которые соединены с основой по фосфорильной группе [-О-Р(О)(ОН)-];
- алкинилкарбонил означает разветвленные или неразветвленные с 3-6 атомами углерода в алкиниле алкинилкарбонильные цепочки с алкинильными группами, как упомянутые выше для R1, которые соединены с основой по карбонильной группе [-(С=0)-];
- алкинилфосфорил означает разветвленные или неразветвленные с 3-6 атомами углерода в алкиниле алкинилфосфорильные цепочки с алкинильными группами, как упомянутые выше для R1, которые соединены с основой по фосфорильной группе [-О-Р(О)ОН-];
- циклоалкил означает разветвленные или неразветвленные циклоалкильные цепочки с 3-20 атомами углерода и с 3-7 атомами углерода в кольце, которое может содержать такие гетероатомы, как сера, азот или кислород, или такие циклические системы, как циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил, циклогептил, 1-метилциклопропил, 1-этил-циклопропил, 1-пропилциклопропил, 1-бутилциклопропил, 1-пентилциклопропил, 1-метил-1-бутилциклопропил, 1,2-диметилциклопропил, 1-метил-2-этилциклопропил, циклооктил, циклононил или циклодецил;
- циклоалкилкарбонил означает разветвленные или неразветвленные с 3-20 углеродными атомами циклоалкилкарбонильные цепочки с 3-7 атомами углерода в кольце, которое может содержать гетероатомы, такие как сера, азот или кислород, или циклические системы, такие как циклопропилкарбонил, циклобутилкарбонил, циклопентилкарбонил, циклогексилкарбонил, циклогептилкарбонил, 1-метилциклопропилкарбонил, 1-этилциклопропилкарбонил, 1-пропилциклопропилкарбонил, 1-бутилциклопропилкарбонил, 1-пентилциклопропилкарбонил, 1-метил-1-бутилциклопропилкарбонил, 1,2-диметилциклопропилкарбонил, 1-метил-2-этилциклопропилкарбонил, циклооктилкарбонил, циклононилкарбонил или циклодецилкарбонил;
- циклоалкилфосфорил означает разветвленные или неразветвленные с 3-20 углеродными атомами циклоалкилфосфорильные цепочки с 3-7 атомами углерода в кольце, которое может содержать такие гетероатомы, как сера, азот или кислород, или циклические системы, как, например, циклопропилфосфорил, циклобутилфосфорил, циклопентилфосфорил, циклогексилфосфорил, циклогептилфосфорил, 1-метилциклопропилфосфорил, 1-этилциклопропилфосфорил, 1-пропилциклопропилфосфорил, 1-бутилциклопропилфосфорил, 1-пентилциклопропилфосфорил, 1-метил-1-бутилциклопропилфосфорил, 1,2-диметилциклопропилфосфорил, 1-метил-2-этилциклопропилфосфорил, циклооктилфосфорил, циклононилфосфорил или циклодецилфосфорил;
- арил означает, например, фенил или нафтил;
- арилкарбонил означает, например, фенилкарбонил или нафтилкарбонил;
- арилфосфорил означает, например, фенилфосфорил или нафтилфосфорил;
- гетарил и гетарильный участок гетарилкарбонила или гетарилфосфорила являются ароматическими моно- или полициклическими остатками, которые наряду с входящими в кольцо углеродными атомами дополнительно могут содержать в кольце от одного до четырех атомов азота или от одного до трех атомов азота и один атом кислорода или серы;
- гликозил означает моно-, ди- или олигосахариды, как, например, глюкоза, галактоза, манноза, фруктоза, фукоза, N-ацетил-D-глюкозамин, мальтоза, лактоза, хитобиоза, целлобиоза или олигосахариды во всех стереоизомерных формах



-S-Cl,





m = 1 - 5;
R5=H, Cl, Вr, F, NO2. Y в соединениях формулы IV имеет указанное для R2 значение и может быть таким же или отличным от R2. Х в соединениях формулы II означает одну из следующих групп - (С=О)-О-, -О-, -NR3-, -S-, -OPO(OR4)-O-, причем R3 и R4 независимо друг от друга означают водород или алкил с 1 - 8 атомами углерода, как, например, метил, этил, н-пропил, 1-метилэтил, н-бутил, 1-метилпропил, 2-метилпропил, 1,1-диметилэтил, н-пентил, 1-метилбутил, 2-метилбутил, 3-метилбутил, 2,2-диметилпропил, 1-этилпропил, н-гексил, 1,1-диметилпропил, 1,2-диметилпропил, 1-метилпентил, 2-метилпентил, 3-метилпентил, 4-метилпентил, 1,1-диметилбутил, 1,2-диметилбутил, 1,3-диметилбутил, 2,2-диметилбутил, 2,3-диметилбутил, 3,3-диметилбутил, 1-этилбутил, 2-этилбутил, 1,1,2-триметилпропил, 1,2,2-триметил-пропил, 1-этил-1-метилпропил, 1-этил-2-метилпропил, н-гептил или н-октил. По группе ХН линкер соединяется с твердой фазой


R5 означает водород, гидроксильную группу, нитрогруппу, при необходимости замещенный алкил с 1-8 атомами углерода, алкоксигруппу с 1-8 атомами углерода, циклоалкил с 3-10 атомами углерода, циклоалкилоксигруппу с 3-10 атомами углерода,
R6 означает замещенный или незамещенный алкил с 1-20 атомами углерода, алкенил с 3-20 атомами углерода, алкинил с 3-6 атомами углерода, алкилкарбонил с 1-20 атомами углерода в алкиле, алкилфосфорил с 1-20 атомами углерода, алкенилкарбонил с 3-20 атомами углерода в алкениле, алкинилкарбонил с 3-6 атомами углерода в алкиниле, алкенилфосфорил с 3-20 атомами углерода, алкинилфосфорил с 3-6 атомами углерода, циклоалкил с 3-20 атомами углерода, циклоалкилкарбонил с 3-20 атомами углерода в циклоалкиле, циклоалкилфосфорил с 3-20 атомами углерода, арил, арилкарбонил, арилфосфорил, гетарил, гетарилкарбонил, гетарилфосфорил, гликозил, замещенные или незамещенные аминокислоты или пептиды,
Q означает иминогруппу или кислород. Остаток R6 следует выбирать так, чтобы образовывались узнаваемые ферментами места, по которым происходит отщепление. Связями, образующимися при подходящем выборе остатка R6 и удовлетворяющими названному выше критерию, являются, например, сложноэфирные связи, простые эфирные связи, связи в амидах кислот, сложноэфирные связи фосфорной кислоты или гликозидные связи. Ферментами, расщепляющими эти связи, являются, например, гидролитические ферменты, как, например, липазы, эстеразы, амидазы, протеазы, пептидазы, фосфатазы, фосфолипазы, пероксидазы или гликозидазы. Достоинством линкера по изобретению, а также способа по изобретению является простое и полное отщепление линкера от продукта. Линкер по изобретению делает возможной широкую палитру проводимых далее синтетических превращений, например создание так называемой библиотеки субстанций в комбинаторной химии, которая при необходимости может быть автоматизирована. Линкер согласно изобретению полезен для применения в твердофазных синтезах. Следующие примеры служат для дальнейшего наглядного объяснения изобретения без ограничения каким-либо способом. Пример 1
Получение 2-ацетокси-5-метилбензойной кислоты

Растворяли 1 г 5-метилсалициловой кислоты (6,58 ммоля) и 1,83 мл триэтиламина (2 эквивалента) в 80 мл этилацетата. При 0oС прибавляли по каплям 0,94 мл хлористого ацетила (2 эквивалента) и затем перемешивали 1 час при 23oС. Выпавшие в осадок соли отфильтровывали. К фильтрату прибавляли 100 мл 1М соляной кислоты и перемешивали в течение ночи. Образовывался гомогенный раствор, рН которого устанавливали около 4 с помощью насыщенного раствора бикарбоната натрия. Затем экстрагировали хлороформом, органическую фазу промывали небольшим количеством воды и сушили над сернокислым магнием. Растворитель затем удаляли и неочищенный продукт перекристаллизовывали из гексана/этилацетата. Выход: 1,21 г (95%). 1Н-ЯМР (дейтерохлороформ): 7,89 (д, J=2 Гц); 7,39 (дд, J=8 Гц; J"=2 Гц); 6,99 (д, J=8 Гц); 2,40 (с, 3Н, метил); 2,31 (с, 3Н, -ОАс). Пример 2
Получение 2-ацетокси-5-бромметилбензойной кислоты

В 20 мл абсолютного четыреххлористого углерода осторожно нагревали в атмосфере аргона при перемешивании 1 г 2-ацетокси-5-метилбензойной кислоты (5,16 ммоля), 1,16 г N-бромсукцинимида (1,25 эквивалента) и 33 мг азодиизобутиронитрила и кипятили 2,5 часа с обратным холодильником при облучении лампой дневного света. Затем охлаждали в бане со льдом, отфильтровывали и промывали отфильтрованный осадок н-пентаном. Кристаллы вместе с маточным раствором смешивали с хлороформом и промывали холодной водой. Органическую фазу сушили над сернокислым магнием и концентрировали. Неочищенный продукт сразу затем перекристаллизовывали. Выход: 1 г (58%) указанного в заглавии соединения, кроме того, получают около 10% 2-ацетокси-5-дибромметилбензойной кислоты (определено с помощью 1Н-ЯМР-спектра). 1Н-ЯМР (дейтерохлороформ): 8,11 (д, J=2 Гц); 7,62 (дд, J=8 Гц, J"=2 Гц); 7,11 (д, J=8 Гц); 4,48 (с, 2Н, -CH2-); 2,33 (с, 3Н, -ОАс). Пример 3
Получение 2-ацетокси-5-гидроксиметилбензойной кислоты

Неочищенный продукт из примера 2 в количестве 1 г (2,99 ммоля) смешивали с 25,5 мл диоксана и 30 мл 0,1 н. раствора азотнокислого серебра и перемешивали в течение ночи при комнатной температуре. Затем экстрагировали несколько раз этилацетатом, объединенные органические фазы высушивали над сернокислым магнием и упаривали досуха. После хроматографирования на колонке в хлороформе/метаноле (5:1) выход составил 389 мг (62%). 1Н-ЯМР (дейтерохлороформ): 8,07 (д, J=2 Гц); 7,61 (дд, J=8 Гц, J"=2 Гц); 7,12 (д, J=8 Гц); 4,73 (с, 2Н, -СН2); 2,32 (с, 3Н, -ОАс). Пример 4
Присоединение анкерного структурного элемента в виде 2-ацетокси-5-гидроксиметилбензойной кислоты к тентагелю


К 500 мг тентагеля

Превращение в сложный эфир хлормуравьиной кислоты

К 210 мг полученного в примере 4 продукта, помещенного в 3,5 мл безводного ТГФ в атмосфере аргона, прибавляли по каплям при 23oС 400 мкл (примерно 12 эквивалентов) раствора фосгена в толуоле (1,93 М). Суспензию перемешивали 2 часа и после прибавления по каплям еще 200 мкл раствора фосгена перемешивали еще 2 часа. Затем последовательно в каждом случае дважды промывали безводным ТГФ, серным эфиром, ТГФ и еще раз серным эфиром и смолу сушили в вакууме. ИК-спектроскопия с Фурье-преобразованием: 1770,5 см-1 (-ОАс и -СОСl), 1666 см-1 (-CONH-), 1540 см-1 (-NH-)
Пример 6
Получение

путем реакции сочетания с хлогидратом трет-бутилового эфира лейцина. Охлажденный в бане с ледяной водой раствор 29 мг хлоргидрата трет-бутилового эфира лейцина (4 эквивалента) и 20 мкл триэтиламина (примерно 5 эквивалентов) в 4 мл безводного хлористого метилена медленно прибавляли при 0oС под аргоном к суспензии 110 мг соединения, полученного согласно примеру 5, в 2 мл хлористого метилена. Суспензию перемешивали 0,5 часа при 0oС и 3 часа при 23oС. Затем последовательно промывали каждый раз безводным метанолом, хлористым метиленом, метанолом и серным эфиром и смолу сушили в вакууме. ИК-спектроскопия с Фурье-преобразованием:
1776 см-1 (-ОАс), 1724 см-1 (-OCONH-), 1666 см-1 (-CONH-), 1540 см-1(-NH-). Пример 7
Отщепление в основных условиях трет-бутилового эфира лейцина для определения поверхностной плотности
Продукт сочетания из примера 6 в количестве 6 мг суспендировали в растворе из 200 мкл ТГФ и 200 мкл насыщенного раствора бикарбоната натрия с рН 10,5 и реакционную смесь встряхивали около 30 мин при 23oС. Затем экстрагировали 200 мкл хлороформа и с применением газовой хроматографии и масс-спектрометрии (ГХ - МС) количественно оценивали органическую фазу с помощью эталона. Доля присоединения трет-бутилового эфира лейцина через анкерный структурный элемент к полимерному носителю относительно имеющихся NH2-групп составляла 51%. Пример 8
Ферментативное отщепление трет-бутилового эфира лейцина
Продукт сочетания из примера 6 в количестве 27 мг суспендировали в 1066 мкл фосфатного буфера (0,1 М двузамещенный фосфорнокислый натрий, 0,2 М йодистый калий, рН 5) и 500 мкл метилового спирта; прибавляли 3 Ед. липазы (из Mucor meihei), растворенной в 100 мкл такого же буфера, и смесь инкубировали при 30oС при встряхивании. Благодаря присутствию иодида в буферном растворе улавливали промежуточный образующийся хинонметин. Через 6 часов и 32 часа прибавляли каждый раз еще 100 мкл раствора липазы. Инкубирование прекращали через 58 часов. Реакционную смесь экстрагировали хлороформом. Объединенные и высушенные органические фазы упаривали до 1 мл и количественно оценивали с помощью ГХ - МС. Выход: 42%.
Класс C07B61/00 Прочие общие способы
Класс C12P13/04 альфа- или бета-аминокислоты
Класс C07C235/12 с атомом азота по меньшей мере одной из карбоксамидных групп, связанным с ациклическим атомом углерода углеводородного радикала, замещенного карбоксильными группами
Класс C07C235/66 с атомами углерода карбоксамидных групп, связанными с атомами углерода шестичленных ароматических колец, не входящих в конденсированные циклические системы, и с атомами кислорода с простыми связями, присоединенными к одному и тому же углеродному скелету